台灣野生動物冷凍遺傳物質典藏中心之建置-DNA條碼計畫 (Ⅲ)

近年，一個「DNA 分類(DNA taxonomy)」或是「分子遺傳分類(molecular taxonomy)」的構想逐漸為人所接受。如果每一份標本都利用相同一段遺傳物質，經過累積資料之後完成建檔，那麼每一個物種就會擁有其獨特的訊息，如同超級市場的條碼系統，稱之為「DNA barcode」。在本年度預定的工作項目中，預定進行山雀科、畫眉科、鶇科、鵯科等鳥類，以及赤蛙科、壁虎科、蝮蛇科、黃頷蛇科等兩棲爬行動物的定序。鳥類部份本年度新完成定序的物種包含20科(含亞科)34種，因此將累積的物種增加至31科73種以上；而兩棲爬行動物方面，則累積4目14科，超過67種的兩棲爬行動物得到至少600 bp的COI序列。各類群的種間均呈現非常明顯的遺傳分化，但種內的變異極為有限，顯示COI適合作為條碼系統的分子遺傳標記。但是利用演化軟體重塑各類群在COI序列上呈現的演化關係，發現物種之間的演化關係與我們熟悉的分類關係並不符合。顯見單純的COI基因片段雖然適合用於物種鑑定，但並不適合進行演化親緣關係的重塑。另一方面，兩棲爬行動物在種間呈現相當大的遺傳分化，同屬之間的遺傳距離平均可達20%，而科間的遺傳距離則達到30%以上，這種巨大的遺傳差異相對地提升我們在進行PCR增幅反應的難度。