珍稀瀕危物種桃實百日青種質遺傳保存與變異研究計畫

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計畫名稱珍稀瀕危物種桃實百日青種質遺傳保存與變異研究計畫
研究類別科技計畫
計畫年度99年
主持機關中山大學
主辦單位林務局保育組棲地經營科
計畫主持人江友中
計畫總經費888,000

中文摘要 桃實百日青為台灣特有種,生存棲地狹隘,僅侷限於南投縣魚池鄉日月潭盆地週遭山地,推測應為第三紀孑遺植物的冰河避難所。完成林業試驗所蓮華池闊葉林長期動態樣區、南投縣道66號的火培坑、南投縣道68號的草南溼地、南投147縣道的北山坑、貓頭山和林業試驗所台北植物園種實苗等六族群,共264單株樣本之基因組DNA萃取與保存,建立桃實百日青之種質遺傳保存庫。五野外族群完成定位與胸高直徑測量工作。野外族群之種質基因組DNA之萃取方式,選用Plant Genomic DNA Miniprep System Kit方法萃取,順利完成264株桃實百日青個體基因組DNA萃取工作。以磁珠富集法建構出桃實百日青(AC)n和(AG)n豐富性微衛星序列基因組基因庫,完成31選殖片段進行引子設計與合成,測試後,16組微衛星體基因座在桃實百日青樣本中具有多型性,跨物種測試結果顯示大葉羅漢松、小葉羅漢松、叢花百日青和蘭嶼羅和松分別為10、9、11和11組微衛星體基因座具有多型性,顯示物種間可以互相使用。在桃實百日青野外胸高直徑調查結果顯示,胸高直徑小於HO)和異基因合子期望值(HE) 分別為 0 – 0.023和0.371 – 0.717,異基因合子偏低,導致自交係數高,顯示基因交流不順暢。分子變異分析(AMOVA)顯示遺傳變異主要保存在個體間,計算分化指數(FST)和基因交流指數(Nm),分別由0.049至0.134和1.620至4.830,族群間則顯示低分化指數和高基因交流數。在MCMC scheme模擬中,以Ln likelihood值和delta K檢測,K= 2、4、15和38時delta K值大於2,推測在K= 2、4、15和38有結構存在。K=2和4的分群方式無法針對不同遺傳單位進行界分評估。K= 15和38則可中各族群內再界分不同遺傳單位,但族群遺傳基因型仍彼此仍有混雜的現象。 關鍵字:桃實百日青、種質遺傳保存、族群遺傳變異、羅漢松屬、微衛星體基因座

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瀏覽人次:1763 最後更新日期:2016-05-11