臺灣肖楠野外族群遺傳多樣性調查及優良樹種選取計畫

一、本計畫完成臺灣肖楠野外16個族群樣本收集，依不同地域特性將其區分為10組分群，合計共採集265個單株。共挑選出539個含有臺灣肖楠微衛星體DNA嵌入片段的轉殖質體，設計出66個專用引子對。多型性測試篩選出20組穩定的微衛星體基因座，遺傳多樣性參數包括對偶基因數目由4至11。有效對偶基因數目為1.12至3.92，平均值為2.39。對偶基因豐富度為1.80至4.63，平均值為3.42。特有對偶基因豐富度以Group_5平均值最高，Group_7平均值最低。異型合子觀測值為0.10至0.75，平均值為0.53。異型合子期望值為0.00至0.96，平均值為0.17。哈溫平衡檢測結果顯示，全樣本檢測所有微衛星體基因座均呈現偏離現象。綜觀遺傳多樣性分析結果顯示Group_5族群之遺傳多樣性最高，Group_7則偏低，此結果顯示臺灣肖楠的遺傳多樣性偏低，與族群經歷冰河事件後所造成的族群收縮進入避難所現象有關。分子變異分析(AMOVA)結果顯示臺灣肖楠的遺傳變異主要保存在族群內個體間，但各階層累積遺傳變異皆呈現顯著性，顯示分群間、分群內族群間的遺傳分化皆顯著。臺灣肖楠自交係數檢測顯示呈現正值顯著偏離現象，顯示基因交流受限，推測其生態棲位受限導致族群隔離。有效族群大小與基因交流評估的結果顯示，臺灣肖楠祖先族群之有效族群大小(NA)的值為1,968,813，但大安溪流域以北族群的現生族群有效族群大小(N1)的值為72，以南(N2)為2874。顯示祖先族群之有效族群大小致現生族群之有效族群數量呈現劇縮，且大安溪為界之南北族群的現生族群有效族群大小數量相差甚多。雙向基因交流程度而言，大安溪流域以北的集群至以南的集群的基因交流值(M1→2)為0.655，反向為(M2→1)為0.016。顯示南北族群基因交流程度低，且基因交流方向不對等。結合不同分群結構分析結果，顯示可以區分為11型基因型家族，其中有7個基因型家族分布的區域獨立，沒有與其他族群共屬此基因型家族。此結果可應用在未來挑選必要的現地保育個體及作為種原母樹林族群等相關保育作業，以期涵蓋此物種最大遺傳多樣性。